Pooride ja akvaporiinide peamine erinevus seisneb selles, et poorid on veega täidetud poorid ja kanalid, mida leidub bakterite ja eukarüootide membraanides. Vahepeal on akvaporiinid membraanivalgud, mis moodustavad elusrakkudes veeselektiivsed kanalid.
Erinevad molekulid lähevad elusorganismides rakku kogu plasmamembraani sisse ja välja. Seega on plasmamembraanis erinevad membraanivalgud, et säilitada ja reguleerida rakkudesse sisenevaid ja sealt väljuvaid molekule. Poriinid ja akvaporiinid on kaks sellist tüüpi membraanivalke. Neist poorid on veega täidetud poorid, mis hõlbustavad hüdrofiilsete molekulide transportimist läbi membraani. Vahepeal on akvaporiinid veeselektiivsed kanalid, mis võimaldavad konkreetselt vett vabalt läbi membraani läbida.
