Peamine erinevus õunhappe ja maleiinhappe vahel on see, et õunhape on küllastunud dikarboksüülhape, samas kui maleiinhape on küllastumata dikarboksüülhape.
Õunhape ja maleiinhape on dikarboksüülhapped. See tähendab, et need ühendid sisaldavad samas molekulis kahte karboksüülrühma (-COOH), mis on kinnitatud kahele erinevale süsinikuaatomile. Õunhappe ja maleiinhappe erinevus seisneb küllastumises (topelt- või kolmiksidemete olemasolu tähendab küllastumatust). Kuna maleiinhappel on kahe süsinikuaatomi vahel kaksikside, on see küllastumata ühend. Kuid õunhappe süsinikuaatomite vahel ei ole topelt- ega kolmiksidemeid.