Oluline erinevus vaba ammoniaaki ja kõigi ammoniaaki, et termin vaba ammoniaagi viitab gaasilised NH 3 molekulid, kuna termin kõigi ammoniaagi viitab summa NH 3 molekule ja amooniumiioonidega.
Ammoniaak on mürgine, gaasilise ainega, mille keemiline valem NH 3. Bioloogilistes süsteemides võib ammoniaaki esineda kahte tüüpi: ioniseeritud vormis ja unioniseeritud vormis. Ioniseeritud kujul on ammooniumiooni mille keemiline valem NH 4 +.