Peamine erinevus Harrise ja Mayeri hematoksüliini vahel on see, et Harrise hematoksüliini kasutatakse regressiivsel värvimisel, samas kui Mayeri hematoksüliini kasutatakse progresseeruvaks värvimiseks.
Hematoksüliin on põhivärv, mida histopatoloogias tavaliselt kasutatakse. See on looduslik värv, mis on saadud puust Haematoxylon campechianum. See on tumesinine või lilla värv. Hematoksüliin võimaldab näidata raku- ja koekomponentide mikroskoopilisi tuumadetaile. See värv on positiivselt laetud, seondub seega negatiivselt laetud ainetega nagu DNA ja RNA ning värvib need violetse värviga. Hematoksüliin nõuab koe komponentidega seondumise hõlbustamiseks peitsit. Mordant on kemikaal, eriti alumiiniumi, raua, volframi sool, mis hõlbustab värvi sidumist koekomponendiga.
Nende sisaldavate peitside põhjal on saadaval mitut tüüpi hematoksüliine. Mõned neist on Ehrlichi, Mayeri, Harrise, Gilli, Delafieldi, Cole'i ja Carazzi hematoksüliinid. Nii Harrise kui ka Mayeri hemoksüliinipreparaadid on alumiiniumil põhinevad söövad hematoksüliinid.
