Peamine erinevus - ülesvoolu vs allavoolu DNA
Et mõista erinevust üles- ja allavoolu DNA vahel, on oluline omada üldisi teadmisi DNA koostise ja struktuuri kohta. DNA koosneb polünukleotiidahelatest. Nukleotiidid on ehitusplokid, mis loovad polünukleotiidahelad ja iga nukleotiid on valmistatud kolmest komponendist: viiesüsinikuline suhkur, lämmastikuga alus ja fosfaatrühm. Fosfaatrühm ja OH-rühm on kinnitatud nukleotiidis vastavalt suhkru molekuli 5 'ja 3' positsiooniga süsiniku külge. Nukleotiidid on omavahel ühendatud fosfodiestersidemetega, mis moodustuvad ühe nukleotiidi 5'-fosfaatrühma ja külgneva nukleotiidi 3'-OH-rühma vahel. Kui polünukleotiidahelal on vaba 5'-fosfaatrühm, määratakse see 5'-otsaks; kui sellel on vaba 3 'OH rühm, määratakse see 3' otsaks. SeetõttuDNA-ahelatel on tavaliselt 5 'ja 3' otsad vastavalt polünukleotiidahelate lõppasenditele. DNA eksisteerib ka kaheahelalisena. Kaks suunda on üksteisega antiparalleelsed. Seetõttu on DNA-l kaks suunda, mis kulgevad 5 'kuni 3' ja 3 'kuni 5' suuna suunas. Üles- ja allavoolu DNA-le viidatakse 5 'kuni 3' mRNA ahela transkriptsioonile ja sünteesile. Kui DNA-d peetakse transkriptsiooni algatamise kohast kodeeriva ahela 5 otsa suunas, on see tuntud kui ülesvoolu DNA. Kui arvestada transkriptsiooni initsiatsioonikohast kodeeriva ahela 3'-otsa DNA-d, nimetatakse allavoolu DNA-d. See on peamine erinevus üles- ja allavoolu DNA vahel. Kaks suunda on üksteisega antiparalleelsed. Seetõttu on DNA-l kaks suunda, mis kulgevad 5 'kuni 3' ja 3 'kuni 5' suuna suunas. Üles- ja allavoolu DNA-le viidatakse 5 'kuni 3' mRNA ahela transkriptsioonile ja sünteesile. Kui DNA-d peetakse transkriptsiooni algatamise kohast kodeeriva ahela 5 otsa suunas, on see tuntud kui ülesvoolu DNA. Kui arvestada transkriptsiooni initsiatsioonikohast kodeeriva ahela 3'-otsa DNA-d, nimetatakse allavoolu DNA-d. See on peamine erinevus üles- ja allavoolu DNA vahel. Kaks suunda on üksteisega antiparalleelsed. Seetõttu on DNA-l kaks suunda, mis kulgevad 5 'kuni 3' ja 3 'kuni 5' suuna suunas. Üles- ja allavoolu DNA-le viidatakse 5 'kuni 3' mRNA ahela transkriptsioonile ja sünteesile. Kui DNA-d peetakse transkriptsiooni algatamise kohast kodeeriva ahela 5 otsa suunas, on see tuntud kui ülesvoolu DNA. Kui arvestada transkriptsiooni initsiatsioonikohast kodeeriva ahela 3'-otsa DNA-d, nimetatakse allavoolu DNA-d. See on peamine erinevus üles- ja allavoolu DNA vahel. Kui DNA-d peetakse transkriptsiooni algatamise kohast kodeeriva ahela 5 otsa suunas, on see tuntud kui ülesvoolu DNA. Kui arvestada transkriptsiooni initsiatsioonikohast kodeeriva ahela 3'-otsa DNA-d, nimetatakse allavoolu DNA-d. See on peamine erinevus üles- ja allavoolu DNA vahel. Kui DNA-d peetakse transkriptsiooni algatamise kohast kodeeriva ahela 5 otsa suunas, on see tuntud kui ülesvoolu DNA. Kui arvestada transkriptsiooni initsiatsioonikohast kodeeriva ahela 3'-otsa DNA-d, nimetatakse allavoolu DNA-d. See on peamine erinevus üles- ja allavoolu DNA vahel.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on DNA ülesvoolu
3. Mis on DNA allavoolu
4. Võrdlus kõrvuti - DNA ülesvoolu ja allavoolu
5. Kokkuvõte
Mis on ülesvoolu DNA?
Geen on organismi DNA-l paiknev struktuurne ja funktsionaalne pärilikkus. Seda hoitakse koos valgu koostamise juhistega. Geenil on DNA molekuli spetsiifiline piirkond. Vajadusel transkribeerub ja muundub valguks mRNA ahela sünteesi kaudu. Tavaliselt kulgeb geeni kodeeriv ahel 5 'kuni 3' suunas. Transkribeerimisel tekitab see mRNA ahela samas suunas 5 'kuni 3'. Transkriptsiooni ajal serveeritakse matriitsahelana 3 'kuni 5' antisense ahelat ja see käivitab mRNA sünteesi. Geenis on transkriptsiooni algatamise koht. Viidates transkriptsiooni initsieerimiskohale, nimetatakse DNA piirkonda kodeeriva ahela 5'-otsa suunas kui ülesvoolu DNA-d. Geeni promootor asub tavaliselt DNA ülesvoolu piirkonnas. Eukarüootsetes geenides ongeeni ülesvoolu asuvas piirkonnas on TATA kastid, promootori proksimaalsed elemendid ja võimendajad. Geeni ülesvoolupiirkonda tähistatakse negatiivsete numbritega. Geeni ülesvoolu DNA on transkriptsiooni jaoks ülioluline.
Mis on allavoolu DNA?
Transkriptsiooni initsiatsioonisaiti tuntakse kui geeni +1 punkti. DNA piirkonda alates +1 punktist kodeeriva ahela 3 'otsa suunas tuntakse allavoolu DNA-na. Teisisõnu, geenist allavoolu asub transkriptsiooni initsiatsioonikohast matriitsi 5 'otsa suunas. Seetõttu sisaldab geenipiirkonna allavoolu DNA transkriptsiooniüksust ja muid järjestusi, näiteks terminaatorjärjestust. Promootor võib mõjutada geeni allavoolu järjestust. Geeni allavoolu viidatakse positiivsete arvudega. Geeni allavoolu DNA on tegelik piirkond, mis annab valguprodukti.
Joonis 01: DNA üles- ja allavool
Mis vahe on DNA ülesvoolu ja allavoolu?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Ülesvool vs allavoolu DNA |
|
| DNA piirkonda transkriptsiooni initsieerimiskohast kodeeriva järjestuse 5'-otsa suunas nimetatakse DNA ülesvooluks. | DNA piirkonda kodeeriva ahela 3 'otsa suunas transkriptsiooni initsiatsioonikohast tuntakse allavoolu DNA-na. |
| Elemendid | |
| Promootorid ja võimendajad asuvad ülesvoolu DNA-l | Transkriptsiooniüksus ja terminaatorjärjestused asuvad allavoolu DNA-s. |
| Numeratsioon | |
| Ülesvoolu piirkonna nukleotiididele viidatakse negatiivsete numbritega | Nukleotiididele viidatakse positiivsete arvudega. |
| Funktsioon | |
| See piirkond sisaldab elemente, mis on vajalikud transkriptsiooni reguleerimiseks ja algatamiseks | See piirkond sisaldab juhiseid valgu tootmiseks ja transkriptsiooni lõpetamiseks |
Kokkuvõte - ülesvoolu vs allavoolu DNA
RNA ahelast üles- ja allavoolu on lihtne kindlaks teha. Võrdluskoha osas on RNA ahela 5 'otsa poole jääv piirkond tuntud kui ülesvoolu RNA, samas kui piirkond 3' otsa suunas on tuntud kui allavoolu RNA. Kuid DNA-s on kaks ahelat, mis kulgevad mõlemas suunas 5 'kuni 3' ja 3 'kuni 5'. Seega on vahe üles- ja allavoolu DNA vahel keeruline. Seetõttu eristatakse seda viitega geeni transkriptsioonile. Transkriptsiooni initsiatsioonikohast senssi ahela 5 otsa suunas tuntakse DNA piirkonda kui ülesvoolu DNA-d, samas kui transkriptsiooni initsieerimiskohast senssi ahela 3 'otsa suunas nimetatakse allavoolu DNA-d. See on erinevus DNA üles- ja allavoolu vahel.
