Peamine erinevus auksiini ja tsütokiniini vahel on see, et auksiin stimuleerib juurte hargnemist, samal ajal kui tsütokiniin pärsib juurte hargnemist ja külgmist juurte moodustumist. Sellele lisaks lisab auksiin peamiselt tüve ja juuretippude rakkude pikenemise eest, samas kui tsütokiniinid vastutavad peamiselt rakkude jagunemise eest ja seega leiduvad need kasvupiirkondades.
Fütohormoonid, tuntud ka kui taimsed hormoonid, on taimede kasvu ja arengu jaoks olulised keemilised ained. Need on orgaanilised molekulid ja toimivad signaalmolekulidena, mis reguleerivad taime arengut. Taimhormoone on viis peamist tüüpi: auksiin, gibberelliin, tsütokiniin, etüleen ja abstsisiinhape. Seega täidavad nad taimede kasvu mõjutamiseks üksi ja koos erinevaid funktsioone.