Fermentatsiooni ja hingamise peamine erinevus seisneb selles, et fermentatsioon toimub hapniku puudumisel, samal ajal kui hingamine vajab hapnikku.
Organismid vajavad rakutoimingute sooritamiseks energiat. Seega genereerivad nad energia molekule ATP kujul. Nad kasutavad erinevaid substraate ja lagunevad erinevateks vormideks ning vabastav energia muundub energia molekulideks, mida rakud saavad kasutada. Glükoos on paljude organismide peamine substraat. Fermentatsioon ja hingamine on kaks rakuprotsessi, mis toodavad energiat glükoosi lagundamise teel mitmel etapil. Hingamine on siiski tõhusam ja toodab rohkem ATP molekule kui kääritamine.
