Peamine erinevus kemoorganotrofide ja kemolitotroofide vahel on see, et kemoorganotroofid on organismid, mis saavad elektrone orgaanilistest ühenditest, kemolitotrofid on organismid, mis saavad elektrone anorgaanilistest ühenditest.
Elusorganisme võib energiaallika ja süsinikuallikate põhjal toitumisrežiimi alusel rühmitada mitmesse kategooriasse. Energiaallikaid on päikesevalgus ja orgaanilised ühendid. Samamoodi on süsinikuallikaid kahte tüüpi: anorgaaniline süsinik ja orgaaniline süsinik. Neli peamist kategooriat on fotoautotroofid, fotoheterotroofid, kemoautotroofid ja kemoheterotroofid. Pealegi on ekvivalendi redutseerimise esmase allika põhjal kaks kategooriat: organotroofid ja litotroofid. Kemoorganotrofid ja kemolitotroofid on kaks rühma, mis kasutavad keemiliste ühendite purustamisel tekkivat energiat. Kuid need erinevad üksteisest elektronidoonori põhjal. Elektroonidoonori allikaks on orgaanilised ühendid kemoorganotroofides, samas kui redutseeriva ekvivalendi allikas on kemolitotroofides anorgaaniline.
