Oligopeptiidi ja polüpeptiidi peamine erinevus seisneb selles, et oligopeptiidid sisaldavad vähe aminohappejääke, samas kui polüpeptiidid sisaldavad suurt hulka aminohappejääke.
Mõisted oligopeptiidid ja polüpeptiidid kuuluvad valkude kategooriasse. Peptiidid on aminohapete lühikesed ahelad. Aminohapped seonduvad üksteisega peptiidsidemete kaudu. Seetõttu võime neid peptiide kategoriseerida nendes peptiidides sisalduvate aminohapete arvu järgi. Näiteks dipeptiidid, tripeptiidid, tetrapeptiidid, oligopeptiidid ja polüpeptiidid.
