Polüpeptiid vs valk
Aminohape on lihtne molekul, mis on moodustatud C, H, O, N ja võib olla S. Sellel on järgmine üldine struktuur.
On umbes 20 tavalist aminohapet. Kõik aminohapped on -COOH, -NH 2 rühmaga ja -H seotud süsiniku. Süsinik on kiraalne süsinik ja alfa aminohapped on bioloogilises maailmas kõige olulisemad. Rühm erineb aminohapetest aminohapetest. Lihtsaim aminohape, milles R rühm on H, on glütsiin. R-grupi järgi võib aminohappeid liigitada alifaatseteks, aromaatseteks, mittepolaarseteks, polaarseteks, positiivselt laetud, negatiivselt laetud või polaarseteks laenguteks jne. Aminohapped on füsioloogilises pH-s 7,4 zwitter-ioonidena. Aminohapped on valkude ehituskivid. Kui kaks aminohapet ühinevad dipeptiidiks, toimub kombinatsioon -NH2- sühe aminohappe rühm teise aminohappe –COOH rühmaga. Veemolekul eemaldatakse ja moodustunud sidet tuntakse peptiidsidemena.
Polüpeptiid
Ahel moodustub suure hulga aminohapete ühendamisel polüpeptiidina. Valgud koosnevad ühest või mitmest nimetatud polüpeptiidahelast. Valgu esmane struktuur on tuntud kui polüpeptiid. Polüpeptiidahela kahest otsast on aminorühm vaba N-otsaga ja c-otsaga on karboksüülrühm vaba. Polüpeptiidid sünteesitakse ribosoomides. Polüpeptiidahela aminohappejärjestuse määravad mRNA koodonid.
Valk
Valgud on elusorganismides üks olulisemaid makromolekulide tüüpe. Valgud võib sõltuvalt nende struktuurist liigitada primaarseteks, sekundaarseteks, tertsiaarseteks ja kvaternaarseteks valkudeks. Aminohapete (polüpeptiid) järjestust valgus nimetatakse primaarseks struktuuriks. Kui polüpeptiidistruktuurid kokku klappivad juhuslikeks paigutusteks, on need tuntud kui sekundaarsed valgud. Tertsiaarsetes struktuurides on valkudel kolmemõõtmeline struktuur. Kui vähesed kolmemõõtmelised valguosad on omavahel seotud, moodustavad nad kvaternaarsed valgud. Valkude kolmemõõtmeline struktuur sõltub vesiniksidemetest, disulfiidsidemetest, ioonsidemetest, hüdrofoobsetest interaktsioonidest ja kõigist teistest intermolekulaarsetest interaktsioonidest aminohapetes. Valgud mängivad elusüsteemides mitut rolli. Nad osalevad struktuuride moodustamisel. Näiteks,lihastes on valgukiud nagu kollageen ja elastiin. Neid leidub ka kõvades ja jäikades konstruktsiooniosades nagu küüned, juuksed, kabjad, suled jne. Täiendavaid valke leidub sidekudedes nagu kõhred. Peale struktuurifunktsiooni on valkudel ka kaitsefunktsioon. Antikehad on valgud ja need kaitsevad meie keha võõraste nakkuste eest. Kõik ensüümid on valgud. Ensüümid on peamised molekulid, mis kontrollivad kogu metaboolset aktiivsust. Lisaks osalevad valgud rakkude signaalimisel. Valke toodetakse ribosoomidel. Valku tootev signaal edastatakse ribosoomile DNA geenidest. Vajalikud aminohapped võivad olla toidust või sünteesida raku sees. Valkude denatureerimine põhjustab valkude sekundaarsete ja tertsiaarsete struktuuride avanemist ja desorganiseerumist. See võib olla tingitud kuumusest, orgaanilistest lahustitest, tugevatest hapetest ja alustest, detergentidest, mehaanilistest jõududest jne.
Mis vahe on polüpeptiidil ja valgul?
• Polüpeptiidid on aminohappeline järjestus, samas kui valgud on valmistatud ühe või mitme polüpeptiidahelaga.
• Valkude molekulmass on kõrgem kui polüpeptiididel.
• Valkudel on vesiniksidemed, disulfiidsidemed ja muud elektrostaatilised vastasmõjud, mis reguleerivad selle kolmemõõtmelist struktuuri erinevalt polüpeptiididest.
