Peamine erinevus valgu seedimise korral maos ja peensooles on see, et valgu seedimine maos toimub pepsiini ja vesinikkloriidhappe toimel, samas kui valgu seedimine peensooles toimub kõhunäärme sekreteeritud trüpsiini ja kümotrüpsiini abil.
Toit, mida me tarbime, seedib seedesüsteemis keemiliselt ja mehaaniliselt. Kui toit on seeditud, imenduvad toitained peensoole kaudu meie vereringesse. Valkude seedimine toimub kahes etapis: maos ja peensoole (kaksteistsõrmiksoole) esimeses osas proteaaside toimel. Maos lagundab pepsiin valgud aminohapeteks ja oligopeptiidideks. Oligopeptiidide edasine seedimine aminohapeteks, dipeptiidideks ja tripeptiidideks toimub peensooles pankrease ensüümide toimel.