Peamine erinevus - minisatelliit vs mikrosatelliit
Korduv DNA on organismide genoomis ikka ja jälle korduvad nukleotiidjärjestused. Korduv DNA moodustab märkimisväärse osa genoomsest DNA-st ja on kolm peamist tüüpi, mida nimetatakse tandemkordusteks, terminaalseteks kordusteks ja vahepealseks korduseks. Tandemkordused on väga korduvad järjestused, mis asuvad üksteise kõrval katkestusteta. Selgroogsete genoomis on kolm peamist tüüpi tandemkordusi. Need on satelliidi DNA, mikrosatelliidi DNA ja minisatelliidi DNA. Minisatelliit on väga korratud DNA lõik, mis koosneb 10 kuni 100 aluspaarist koosneva korduva järjestuse reast. Mikrosatelliit on korduva DNA lõik, mis koosneb lühikestest korduvatest järjestustest, mis koosnevad 1 kuni 9 aluspaarist. Seetõttupeamine erinevus minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel on korduva järjestuse suurus või pikkus.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on minisatelliit
3. Mis on mikrosatelliit
4. Minisatelliidi ja mikrosatelliidi sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - minisatelliit vs mikrosatelliit tabelina
6. Kokkuvõte
Mis on minisatelliit?
Minisatelliit-DNA on DNA osa, mis sisaldab lühikese DNA korduva järjestuse rida, mille pikkus on 10–60 alust. Minisatelliite nimetatakse ka muutuva arvuga tandemkordusteks (VNTR). Minisatelliite segatakse sageli mikrosatelliitidega. Kuid nüüd eristatakse minisatelliite ja mikrosatelliite, lähtudes teadlaste korduva järjestuse suurusest.
Minisatelliite võib näha inimese genoomis enam kui 1000 asukohas. Need lühikesed järjestused on rikkad G ja C. Korduste arv antud minisatelliidis varieerub indiviiditi väga erinevalt.
Esimese inimese minisatelliidi tuvastasid AR Wyman ja R. White 1980. aastal. Hiljem avastas Alec Jeffreys organismide seas minisatelliitide koopiate arvu äärmise polümorfismi. Need avastused tegid minisatelliidid ideaalsete markeritena DNA sõrmejälgede võtmiseks, sidemete analüüsiks ja populatsiooniuuringuteks. Minisatelliidid aitavad kaasa ka geeniekspressiooni, transkriptsiooni, alternatiivse splaissingu jms reguleerimisele.
Mis on mikrosatelliit?
Mikrosatelliit on DNA lõik, millel on lihtsad järjestuste kordused 1–10 aluspaari pikkused. Mikrosatelliite nimetatakse ka lühikese järjestuse kordusteks (SSR) või lihtsateks tandemkordusteks (STR). On kahte tüüpi mikrosatelliite, mida nimetatakse lihtsateks mikrosatelliitideks ja liitmikroselliitideks. Lihtsad mikrosatelliidid koosnevad ainult ühte tüüpi korduvatest järjestustest. Komposiitmikrosatelliidid koosnevad mitmest tüüpi kordustest. Mikrosatelliitidel on kõige sagedamini polü A / T piirkonnad. Mikrosatelliidid on koodominantsed ja eukarüootsetes genoomides rohkesti.
Sarnaselt minisatelliitidele näitavad ka mikrosatelliidid üksikisikute seas polümorfismi. Konkreetse mikrosatelliidi korduste arv on indiviiditi erinev. Seetõttu saab mikrosatelliite kasutada ka DNA sõrmejälgede võtmisel geneetiliste markeritena. Mikrosatelliidi polümorfismi saab PCR-i ja geelelektroforeesi abil hõlpsasti tuvastada. Mikrosatelliidi külgnev piirkond on sugulasliikidel väga konserveerunud.
Millised on minisatelliidi ja mikrosatelliidi sarnasused?
- Minisatelliidid ja mikrosatelliidid ei kodeeri DNA järjestusi.
- Mõlemad on tandem kordused.
- Mõlemad koosnevad väga korduvatest järjestustest.
- Mõlemat saab kasutada DNA sõrmejälgede võtmisel võimsate geneetiliste markeritena.
Mis vahe on minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Minisatelliit vs Microsatelliit |
|
| Minisatelliidid on tandem-kordused, mille monomeeri korduse pikkus on 10 kuni 100 aluspaari. | Mikrosatelliidid on lühikesed tandemkordused, mis koosnevad 1 kuni 9 aluspaarist monomeeri korduvatest järjestustest. |
| Korduva järjestuse suurus | |
| Minisatelliidil on 10 kuni 100 aluspaari korduvad järjestused. | Mikrosatelliidil on lühikesed järjestused 1 kuni 9 aluspaariga. |
| Ühised alused | |
| Minisatelliidid on rikkad G- ja C-alustega. | Mikrosatelliidid on rikkad A- ja T-alustega. |
| Muud nimed | |
| Minisatelliite tuntakse ka kui muutuva arvuga tandemkordusi (VNTR). | Mikrosatelliite tuntakse ka lühikese järjestuse kordustena (SSR) või lihtsate tandemkordustena (STR). |
Kokkuvõte - minisatelliit vs mikrosatelliit
Minisatelliit ja mikrosatelliit on kahte tüüpi tandemkordusi. Neid eristatakse aluste arvu järgi korduvas järjestuses või järjestuse suuruse järgi. Minisatelliidil on 10 kuni 100 aluspaari pikkuse korduv järjestus, samal ajal kui mikrosatelliidil on 1 kuni 9 aluspaari pikkuse korduv järjestus. See on peamine erinevus minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel. Korduvate järjestuste koopiate arv minisatelliitides ja mikrosatelliitides on indiviiditi väga erinev. Nii minisatelliidid kui ka mikrosatelliidid on võimsad DNA markerid geneetilise variatsiooni analüüsimiseks liikide populatsioonide sees ja vahel.
Laadige alla Minisatelliidi vs Microsatelliidi PDF-versioon
Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja kasutada võrguühenduseta eesmärkidel, nagu viidatud märkustele. Laadige siit alla PDF-versioon. Erinevus minisatelliidi ja mikrosatelliidi vahel.
