Peamine erinevus klassikalises ja tänapäevases geneetikas on see, et klassikaline geneetika on Mendeli geneetika või vanem geneetika mõiste, mis väljendus üksnes aretuskatsetest tulenevate fenotüüpide põhjal, samas kui tänapäevane geneetika on uus geneetika mõiste, mis võimaldab otsest geneetikat genotüüpide uurimine koos fenotüüpidega.
Suur teadlane Gregor Mendel on geneetika isa. Mendel tutvustas mitmeid seadusi, mis puudutavad tunnuste pärimist ja seda, kuidas tunnused lähevad vanemalt järglastele. Seega said tema leiud täiesti uue kontseptsiooni aluseks, mis avastati hiljem geneetikas. Seetõttu on klassikaline geneetika ja kaasaegne geneetika kaks erinevat mõistet. Kuid klassikaline geneetika on kaasaegse geneetika alus.