Peamine erinevus neurotransmitterite ja hormoonide vahel on see, et neurotransmitterid on keemilised käskjalad, mida närvisüsteem kasutab närviimpulsi edastamiseks kogu sünapsis, hormoonid on aga kemikaalid, mida endokriinsüsteem kasutab spetsiifiliste märklaudrakkude stimuleerimiseks või nendega suhtlemiseks.
Närvisüsteem ja endokriinsüsteem on meie kehas väga olulised elundisüsteemid, mis reguleerivad erinevaid tegevusi. Mõlemad süsteemid sõltuvad spetsiaalsete kemikaalide eraldumisest kas vastavalt neurotransmitterite või hormoonidena. Need neurotransmitterid ja hormoonid toimivad keemiliste saadetajatena ning hõlbustavad närviimpulsside ülekannet ja füsioloogiliste tegevuste reguleerimist meie kehas.