Peamine erinevus sünergiidi ja munaraku vahel on see, et sünergiidirakk on üks kahest munarakuga kaasas olevast rakust, samas kui munarakk on naissugurakk või angiospermide naissugurakk.
Lill on õistaimede paljunemisstruktuur. Lille sees on isas- ja emasloomade reproduktiivstruktuurid. Gynoecium on naise reproduktiivstruktuur ja see koosneb stigmast, stiilist ja munasarjast. Munasarja sees on naissoost gametofüüt ja see on tuntud ka kui embrüokott või megagametofüüt. Embrüokott sisaldab naissoost sugurakku või angiospermide munarakku. Munaraku ümber võib leida veel mitmeid rakke. Nende hulgas on munarakuga kaks sünergiidirakku.