Peamine erinevus polümeeri ja makromolekuli vahel on see, et polümeer on makromolekul, mille kogu molekulaarstruktuuris on korduv üksus, mida nimetatakse monomeeriks, samas kui mitte iga makromolekuli struktuuris pole monomeeri.
Polümeeri ja makromolekuli erinevus tuleneb asjaolust, et polümeer on makromolekuli alajaotus. Makromolekulid on äärmiselt suured ja suure molekulmassiga molekulid. Samuti võime makromolekuli selle struktuuri järgi jagada kahte põhikategooriasse. Nimelt on need polümeriseeritud molekulid ja polümeerimata molekulid. Teiselt poolt moodustub polümeer väikeste molekulide, mis on monomeerid, polümerisatsioonist. Kuid kõik makromolekulid ei sisalda kogu struktuuris korduvat monomeerühikut.
