Peamine erinevus ribosüümide ja valguensüümide vahel on see, et ribosüümid on RNA molekulid, mis on võimelised katalüüsima teatud spetsiifilisi biokeemilisi reaktsioone, samas kui valguensüümid on valgumolekulid, mis on võimelised katalüüsima enamikku elusorganismides esinevatest biokeemilistest reaktsioonidest.
Ensüümid on bioloogilised katalüsaatorid ja need kiirendavad biokeemiliste reaktsioonide kiirust. Üldiselt on kõik ensüümid proteiinid, mis koosnevad aminohapetest. Seega nimetatakse neid ka valguensüümideks. Siiski on olemas spetsiifilised RNA molekulid, mis võivad toimida spetsiifiliste biokeemiliste reaktsioonide katalüsaatoritena. Need on ribosüümid või ribonukleiinhappe ensüümid. Seetõttu täidavad nii ribosüümid kui ka valguensüümid sama funktsiooni, mis on biokeemiliste reaktsioonide katalüüsimine.
