Peamine erinevus kemotaksise ja fagotsütoosi vahel on see, et kemotaksis on rakkude või organismi suunatud ränne mööda keemilise kontsentratsiooni gradienti, samas kui fagotsütoos on mehhanism, mis neelab võõrad nakkusosakesed nende neutraliseerimiseks või hävitamiseks.
Leukotsüüdid on immuunsüsteemi olulised rakud. Need on valged verelibled. Mõned leukotsüüdid on fagotsüüdid. Fagotsüüdid kasutavad võõrosakeste neelamiseks fagotsütoosi. Monotsüüdid, neutrofiilid ja makrofaagid on mõned näited fagotsüütidest. Antigeenide või võõrosakesteni jõudmiseks kasutavad fagotsüüdid kemotaksist. Kemotaksis on rakkude või organismide liikumine keemiliste stiimulite suunas või neist eemale. Lisaks mobiliseeruvad fagotsüüdid ja immuunrakud kemotaksise kaudu nakatumiskohta, koevigastusi ja immuunreaktsioone.