Peamine erinevus hüaloplasma ja tsütosooli vahel on raku organellide puudumine ja olemasolu. Hüaloplasm koosneb struktuurita vedelikust, tsütosool aga vedelikest ja struktureeritud organellidest.
Hüaloplasm ja tsütosool on rakus leiduvad orgaanilised vedelikud. Neid võib täheldada prokarüootsetes rakkudes ja ka eukarüootsetes rakkudes. Hüaloplasm viitab tsütosooli vedelale osale, mis ei sisalda ühtegi struktuuri. Võrdluseks on tsütosool vedel faas, mis koosneb raku struktuuriosadest peale tuuma.
