Peamine erinevus immunosupressiooni ja immuunpuudulikkuse vahel on see, et immunosupressioon viitab immuunsüsteemi efektiivsuse vähenemisele, samas kui immuunpuudulikkus viitab immuunsüsteemi võimetusele võidelda nakkusetekitajate vastu.
Immuunsüsteem tuvastab laia valiku meie kehasse sisenevaid nakkusetekitajaid ja kaitseb meid haiguste eest. Seetõttu on see meie keha kaitsesüsteem. See koosneb erinevat tüüpi immuunrakkudest. Immuunsüsteem toimib kahe alamsüsteemi kaudu: kaasasündinud immuunsüsteem ja adaptiivne immuunsüsteem. Tervel isikul töötab immuunsüsteem normaalselt ja see hoiab ära haiguste esinemise. Kuid kui immuunsüsteemis on häireid, ei tööta see aktiivselt. Immuunpuudulikkus on selline seisund, kus immuunsüsteemi võime haiguste vastu võidelda muutub madalaks või puudub üldse; immunosupressioon on veel üks immuunsusega seotud seisund, mille korral immuunsüsteemi efektiivsus väheneb.
