Peamine erinevus SIR- ja SEIR-mudeli vahel on see, et SIR on üks lihtsamaid epidemioloogia mudeleid, millel on kolm vastuvõtlikku, nakatunud ja taastunud sektsiooni, samas kui SEIR on SIR-i tuletis, millel on neli vastuvõtlikku, paljastatud, nakatunud ja taastunud sektsiooni.
Epidemioloogia uurib, kui tihti haigusi esineb erinevates inimrühmades ja miks. Teisisõnu, epidemioloogia analüüsib tervise ja haigusseisundite jaotust, mustreid ja määravaid tegureid määratletud populatsioonides. Sellel on sektsioonimudelid, mis on nakkushaiguste matemaatiline modelleerimine. Nendes mudelites on populatsioon jaotatud osadeks ja seda kasutatakse haiguse leviku ennustamiseks. SIR ja SEIR on epidemioloogias kasutatavad kaks mudelit. Tegelikult on SIR üks lihtsamaid ja põhilisi mudeleid ning SEIR on selle edasiarendus. SIR-mudelis on kolm sektsiooni S, I ja R, SEIR-mudelis aga neli sektsiooni S, E, I ja R.