Peamine erinevus komposiit- ja mittekomposiittransposoonide vahel on see, et komposiittransposoonidel on kaks külgnevat sisestusjärjestust, samas kui mittekomposiittransposoonidel on külgnevate sisestusjärjestuste asemel tagurpidi kordused.
Transposoon on DNA fragment, mis võib translokatseeruda bakteri genoomis. Need on liikuvad DNA järjestused. Nad liiguvad genoomi uutesse kohtadesse. Need liikumised muudavad bakterite genoomi järjestust, põhjustades olulisi muutusi geneetilises informatsioonis. Need on ülekantavad geneetilised elemendid, mis vastutavad bakterites uute geneetiliste järjestuste loomise eest. Transposoone nimetatakse ka hüppavateks geenideks, kuna need hüppavad järjestused võivad blokeerida geenide transkriptsiooni ja korraldada ümber bakteri geneetilise materjali. Veelgi enam, nad vastutavad ravimiresistentsuse, antibiootikumiresistentsuse geenide liikumise eest plasmiidide ja kromosoomide vahel. Transposoone on kahte tüüpi komposiit- ja mittekomposiittransposoone.