Peamine erinevus tardiivse düskineesia ja düstoonia vahel on see, et tardiivne düskineesia on neuroleptikumide pikaajalisel kasutamisel alati teisejärguline, kuid düstoonia võib olla põhjustatud mitmetest muudest põhjustest. Düstoonia on ebanormaalne lihastoonus, mis põhjustab lihasspasme või ebanormaalseid asendeid. Tardiivne düskineesia viitab kontrollimatule suuhooldamisele ja huulte löömisele grimassidele, mis tekivad pärast neuroleptikumide pikaajalist kasutamist.
Mõlemad need seisundid on ebanormaalsed liikumishäired; düstooniad hõlmavad mitmesuguseid liikumishäireid, mis ilmnevad erinevatel põhjustel, samas kui tardiivne düskineesia on ainult primaarsete düstooniate alarühm.