Peamine erinevus peptiidi ja dipeptiidi vahel on see, et peptiid on lühike aminohapete ahel, mis seob üksteist peptiidsidemete kaudu, samas kui dipeptiid on peptiidi vorm, millel on kas kaks ühe peptiidsidemega ühendatud aminohapet või üks kaks peptiidsidet.
Aminohapped on valkude ehituskivid. Seetõttu moodustavad nad üksteisega peptiidsidemeid, moodustades aminohapete lühikesed ahelad; nimetame neid “peptiidideks”. Pikad ja pidevad peptiidahelad on “polüpeptiidid”. Need polüpeptiidahelad ühendavad omavahel valke. Termin peptiid on tavaline termin, mida kasutame aminohapete lühikese ahela nimetamiseks, kuid termin dipeptiid on spetsiifiline termin, mida kasutame teatud tüüpi peptiidide nimetamiseks.