Peptiid vs valk
Aminohappeid, peptiide ja valke nimetatakse sageli seotud terminiteks, kuid need on oma omaduste poolest erinevad. Aminohapped on nii peptiidide kui valkude ehitusmaterjalid. Aminohape on väike molekul, mis sisaldab aminorühma (-NH 2) ja karboksüülrühma (-COOH), millest igaüks on seotud keskse süsiniku aatom, koos täiendava vesinikust ja kõrvalahel (R- grupis). See külgahel varieerub kõigis aminohapetes; seega määrab see iga aminohappe unikaalsed märgid ja keemia. Konkreetset geenijärjestust kasutatakse aminohapete järjestuse määramiseks nii peptiidides kui valkudes.
Peptiid
Peptiidid koosnevad kahest või enamast aminohappest, mis on seotud peptiidsidemetega ja esinevad lineaarsete ahelatena. Peptiidi pikkus määratakse selles sisalduvate aminohapete hulga järgi. Tavaliselt on peptiidi pikkus alla umbes 100 aminohappe.
Eesliiteid kasutatakse peptiidide tüübi kirjeldamiseks üldterminoloogias. Näiteks kui peptiid on valmistatud kahest aminohappest, nimetatakse seda dipeptiidiks. Nii ühendatakse tripeptiidide saamiseks kolm aminohapet, tetrapeptiidide saamiseks neli aminohapet. Peale nende tüüpide on veel oligopeptiide (koosneb 2-20 aminohappest) ja polüpeptiide, millel on palju peptiide (vähem kui 100). Peptiidide kõige olulisemad iseloomulikud omadused määratakse aminohapete koguse ja järjestuse järgi.
Enamiku peptiidide peamine ülesanne on võimaldada tõhusat suhtlemist, kandes biokeemilisi sõnumeid kehas ühest kohast teise.
Valk
Valgud on kõige mitmekesisem bioloogiliste makromolekulide rühm. Valk koosneb ühest või mitmest pikast hargnemata ahelast, mida nimetatakse polüpeptiidideks ja ometi on valkude ehitusmaterjalid aminohapped. Aminohappejärjestus määrab valgu peamised omadused, samas kui selle aminohappejärjestuse määratleb konkreetne geenijärjestus.
Tavaliselt on valkudel stabiilne kolmemõõtmeline struktuur. Neid struktuure saab arutada nelja taseme hierarhia kujul; esmane, sekundaarne, tertsiaarne ja kvaternaarne. Esmane struktuur on valgu aminohappeline järjestus. Sekundaarne struktuur tekib kahe lähedalasuva aminohappe vahel vesiniksidemete moodustamise teel, mille tulemuseks on struktuurid, mida nimetatakse β-kaetud lehtedeks, ja poolid, mida nimetatakse α-heeliksiteks. Sekundaarse struktuuri piirkonnad volditakse seejärel ruumis edasi, moodustades valgu lõplikud kolmemõõtmelised struktuurid. Mitme polüpeptiidi paigutus ruumis annab valgu kvaternaarse struktuuri.
Valkude peamised funktsioonid on ensüümide katalüüs, kaitse, transport, tugi, liikumine, reguleerimine ja säilitamine.
Mis vahe on peptiidil ja valgul?
• Peptiidid on aminohapete lühikesed lineaarsed ahelad, valgud aga väga pikad aminohapete ahelad.
• Mitmed aminohapped ühendatakse peptiidsidemete abil peptiidiks, mitmed peptiidid seotakse omavahel valgumolekulideks.
• Tavaliselt on valkudel stabiilne kolmemõõtmeline struktuur. Seevastu peptiidid ei ole paigutatud stabiilsesse kolmemõõtmelisse struktuuri.
• Peptiidi pikkus on alla umbes 100 aminohappe, samas kui valgu pikkus on üle 100 aminohappe. (On ka erandeid; seega sõltuvad erinevused pigem molekulide funktsioonist kui nende suurusest)
• Erinevalt peptiididest peetakse valke makromolekulideks.
• Peptiidides moodustavad vesiniksidemeid ainult aminohapete kõrvalahelad. Kui valkudes moodustavad vesiniksidemeid mitte ainult külgahelad, vaid ka peptiidirühmad. Need vesiniksidemed võivad olla veega või teiste peptiidirühmadega.
• Kõik peptiidid eksisteerivad lineaarsete ahelatena, samas kui valgud võivad esineda primaarsete, sekundaarsete, tertsiaarsete ja kvaternaarsetena.
