Peamine erinevus protoksüleemi ja metaksüleemi vahel on see, et protoksüleem on esimene moodustunud primaarne ksüleem, millel on väiksemad rakud, eriti kitsad anumad ja trahheidid, samas kui metaksüleem on hiljem moodustunud primaarne ksülem, millel on suuremad rakud, eriti laiemad anumad ja trahheidid.
Ksülem on üks taimede kahest tüüpi vaskulaarsetest kudedest. Xylem viib vee ja mineraalide liikumise ülespoole juurtest taime teistesse osadesse. See on torusarnane struktuur, mis sisaldab erinevat tüüpi spetsialiseeritud rakke, sealhulgas anumaelemente, trahheide, parenhüümi ja kiude. Ksüleeme on kahte tüüpi: esmane ksüleem ja sekundaarne ksüleem. Primaarne ksüleem areneb primaarse kasvu ajal. Pealegi on primaarsel ksüleemil kaks osa: protoksüleem ja metaksüleem. Nii protoksüleem kui ka metaksüleem pärinevad prokambiumist primaarse kasvu ajal. Protoksüleem pärineb kõigepealt ja metaksüleem pärast protoksüleemi.
