Peamine erinevus väikeaju ja väikeaju vahel on see, et väikeaju on esiosa suurim osa, samas kui väikeaju on tagajäägi suurim osa.
Selgroogsete närvisüsteem koosneb kolmest põhisüsteemist: kesknärvisüsteem, perifeerne närvisüsteem ja autonoomne närvisüsteem. Kesknärvisüsteem koosneb kahest peamisest osast: aju ja seljaaju. Väikeaju ja väikeaju on inimese aju kaks peamist osa. Kuid väikeaju kuulub esiaju, samas kui väikeaju kuulub aju. See artikkel keskendub peamiselt väikeaju ja väikeaju erinevusele.