Peamine erinevus lipulaeva ja katuseliigi vahel on see, et lipuliik on liik, mis toimib määratletud elupaiga sümbolina või ikoonina, samas kui katuseliigid on liigid, mis on kaudselt seotud paljude teiste liikide kaitsega ökosüsteemi või maastiku tasandil.
Ökosüsteemis on elusorganisme erinevat tüüpi. Need liigid suhtlevad omavahel erinevat tüüpi protsesside kaudu, nagu röövloom, parasiitlus, vastastikune suhtumine, sümbioos ja konkurents. Liikide kaitse võib olla subjektiivne ja liikide seisundi määramine pole lihtne. Seetõttu saab säilitamise hõlbustamiseks kasutada mõnda liiki, näiteks katuseliike, põhikiviliike ja lipuliike. Nende liikide muutused näitavad teiste liikide seisundit ökosüsteemis. Seega muudab see kaitse-alased otsused lihtsamaks.
