Peamine erinevus - genoomika vs proteoomika
Genoomika ja proteoomika on molekulaarbioloogia kaks olulist haru. Genoom on organismi geneetiline materjal. See sisaldab geene, mis on kirjutatud organismide geneetilise teabega (geneetilised koodid). Genoomi kohta teabe leidmiseks läbi viidud uuringuid nimetatakse genoomikaks. Geeni nukleotiidjärjestus määrab geneetilise koodi kaudu valgu aminohappelise järjestuse. Geenid transkribeeritakse mRNA-ks ja mRNA tõlgitakse vajalike valkude tootmiseks. Proteoom tähistab organismi kogu ekspresseeritud valke. Rakus sisalduva kogu valgu omaduste, struktuuride, funktsioonide ja ekspressioonide leidmiseks läbi viidud uuringuid nimetatakse proteoomikaks. Seegapeamine erinevus genoomika ja proteoomika vahel on see, et genoomika on molekulaarbioloogia haru, mis uurib organismi geene, samas kui proteoomika on molekulaarbioloogia haru, mis uurib rakkude üldvalke. Genoomiuuringud on olulised organismi geenide struktuuri, funktsiooni, asukoha ja reguleerimise mõistmiseks. Proteoomika uuringud on kasulikumad, kuna valgud on rakkudes tõelised funktsionaalsed molekulid ja esindavad tegelikke füsioloogilisi tingimusi.
SISU
1. Ülevaade ja peamine erinevus
2. Mis on genoomika
3. Mis on proteoomika
4. Võrdlus kõrvuti - genoomika vs proteoomika
5. Kokkuvõte
Mis on genoomika?
Genoomika on kogu organismi genoomi uurimine. See on oluline molekulaarbioloogia haru, mis tegeleb rekombinantse DNA tehnoloogia, DNA järjestamise ja bioinformaatikaga, et uurida genoomi (organismide täielik DNA komplekt) struktuuri ja funktsiooni. DNA koosneb neljast alusest ja geenis sisalduv geneetiline teave on kirjutatud neljas aluskeeles, mis on vajalikud organismi valmistamiseks. Geenid vastutavad valkude valmistamise eest ja need on DNA ühikud, mis kannavad juhiseid konkreetse valgu või valkude komplekti valmistamiseks rakus. Seega on geenide kohta läbi viidud uuringud keeruliste haiguste, geneetiliste häirete, mutatsioonide, oluliste geeniregulatsioonide, geenide ja keskkonnategurite koostoime, haiguste diagnoosimise,ravimeetodite ja ravimeetodite väljatöötamine jne. Seega on genoomiuuringud väga olulised, kuna need käsitlevad kõiki geene ning nende koostoimeid ja käitumist.
Joonis 01: Genoomika kasutamine
Mis on proteoomika?
Valgud on rakkudes leiduvad olulised makromolekulid. Need on olulised paljude organismis esinevate füsioloogiliste funktsioonide jaoks. Peaaegu kõiki biokeemilisi reaktsioone katalüüsivad rakkudes olevad valgud. Geene säilitatakse valkude tootmiseks koos geneetiliste juhistega. Geneetiline kood muundatakse aminohappejärjestuseks, mis määrab konkreetse valgu. See protsess on tuntud geeniekspressioon. Vajadusel ekspresseeritakse ja sünteesitakse geene valkudena. Kogu rakkude valkude komplekt on tuntud kui proteoom. Raku proteoomi uurimine on tuntud kui proteoomika. Valkude struktuure, omadusi, koostoimeid ja funktsioone uuritakse proteoomika all, et uurida, kuidas valgud mõjutavad rakuprotsesse.
Organismid sisaldavad tuhandeid erinevaid valke, mis täidavad rakkudes mitmesuguseid funktsioone. Genoomsed uuringud pakuvad põhiteavet proteoomiuuringute läbiviimiseks, kuna geenid kodeerivad mRNA molekule ja mRNA kodeerivad valke. Proteoomika uuringud on olulised paljudes valdkondades; see on eriti kasulik vähi bioloogias, kus seda saab kasutada vähktõbe põhjustavate ebanormaalsete valkude paljastamiseks.
Joonis 02: Valkude süntees
Mis vahe on genoomikal ja proteoomikal?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Genoomika vs proteoomika |
|
| Genoomika on organismi genoomi uurimine. Geene uuritakse genoomika all. | Proteoomika on raku tervete valkude uurimine. Valke uuritakse proteoomika all. |
| Uuringupiirkonnad | |
| Genoomika hõlmab genoomi kaardistamise, sekveneerimise, ekspressioonianalüüsi, geenistruktuuri analüüsi jne valdkonda. | Proteoomika hõlmab valkude iseloomustamist, valkude struktuuri ja funktsiooni uurimist jne. |
| Klassifikatsioon | |
| Kaks peamist tüüpi nimetasid struktuurgenoomikat ja funktsionaalset genoomikat. | Kolm peamist kategooriat nimetasid struktuurset proteoomikat, funktsionaalset proteoomikat ja ekspressiooniproteoomikat. |
| Õppematerjali laad | |
| Genoom on pidev. Igal organismi rakul on sama geenikomplekt. | Proteoom on dünaamiline ja varieeruv. Erinevates kudedes toodetud valkude komplekt varieerub vastavalt geeniekspressioonile. |
Kokkuvõte - genoomika vs proteoomika
Genoomika on organismi täieliku genoomi uurimine. Proteoomika on molekulaarbioloogia haru, mis uurib kogu rakus ekspresseeritud valkude komplekti, et mõista valkude struktuuri ja funktsioone ning kuidas valgud mõjutavad rakuprotsesse. Genoomika ei suuda valkude sünteesi käigus toimunud translatsioonijärgsete modifikatsioonide tõttu rakkude tegelikke tingimusi selgitada. Seega on proteoomika oluline rakkude tegelike tingimuste ja funktsioonide mõistmiseks. See on erinevus genoomika ja proteoomika vahel.
