Peamine erinevus 2D ja 3D rakukultuuri vahel on see, et 2D rakukultuuris kasutatakse kunstlikku tasast pinda, tavaliselt Petri tassi või rakukultuuriplaati, samas kui 3D rakukultuuris kasutatakse substraati, mis jäljendab selle konkreetse rakutüübi rakuvälist maatriksit.
Rakukultuur on protsess, mis kasvatab rakke kontrollitud tingimustes tavaliselt väljaspool nende looduslikku keskkonda. 2D- ja 3D-rakukultuuri on kahte tüüpi. Nii 2D- kui ka 3D-rakukultuuri süsteemid on terapeutiliste ainete, ravimite ja muude biokeemiliselt aktiivsete ühendite in vitro testimisel väga kasulikud ja neid võib pidada alternatiiviks loomkatsete suhtes. Need kaks kultuurisüsteemi erinevad üksteisest raku adhesioonipinna poolest.
