Peamiseks erinevuseks vahel steriliseerimine ja desinfitseerimine on see, et steriliseerimine on protsess tapmises igasuguse mikroobse elu sealhulgas spoorid esineb mõne eseme desinfitseerimine on protsess vähendamise või kaotamise kahjulike mikroorganismide alates elutu objekti ja pinnad.
Mikroorganismid on üldlevinud. Kuna need põhjustavad saastumist, nakatumist ja lagunemist, on vajalik nende saastest puhastamine materjalidest või aladelt eemaldada või hävitada. Steriliseerimine ja desinfitseerimine on kaks saastatusest puhastamise viisi. Desinfitseerimise eesmärk on mikroobide hävitamine tasemeni, mida nakkus ei edasta, kuid see ei pruugi tingimata hävitada kõiki eluta objektis leiduvaid mikroorganisme. Steriliseerimine on aga saastatusest puhastamise protsess, mille käigus kõik objektis esinevad mikroorganismid hävivad ja sellest tulenevalt muutub objekt steriilseks. Seetõttu tapab steriliseerimisprotsess ka eosed, kaasa arvatud bakterite endospoorid. Lühidalt,võime öelda, et steriliseerimine tapab kõik objektis või kohas esinevad mikroorganismid, samas kui desinfitseerimine vähendab kahjulike mikroorganismide arvu, et levikut takistada.
