Peamine erinevus replikatsiooni ja transkriptsiooni vahel on see, et replikatsioon on protsess, mis toodab originaalsest DNA molekulist kaks identset DNA koopiat, samas kui transkriptsioon on geeniekspressiooni esimene etapp, mis toodab mRNA molekuli DNA matriitsist.
Rakud jagunevad ja suurenevad, et kasvada ja areneda. Pealegi on nende põlvkondade säilitamiseks vajalik paljunemisrakkude tootmine. Rakutsükkel on sündmuste jada, mis on seotud rakust uute tütarrakkude tootmisega. Rakutsükli ajal on kaks protsessi, mida nimetatakse replikatsiooniks ja transkriptsiooniks, ülimalt olulised. Sellepärast, et replikatsioon hõlbustab geneetilise teabe edastamist järgmisele põlvkonnale, samas kui transkriptsioon hõlbustab tuumade jagunemiseks vajalike valkude tootmist. Nii replikatsioon kui ka transkriptsioon toimuvad rakutsükli interfaasis, kuid erinevates alafaasides.
