Peamine erinevus prokarüootse ja eukarüootse transkriptsiooni vahel on see, et prokarüootne transkriptsioon toimub tsütoplasmas, samas kui eukarüootne transkriptsioon toimub tuuma sees.
Rakus kannab DNA teavet raku tegevust kontrollivast põlvest põlve. Pealegi vastutab DNA kõigi valkude sünteesimise eest, millel on rakus nii funktsionaalne kui ka struktuurne roll. Seetõttu kontrollib DNA selliste valkude sünteesimisel raku aktiivsust. Geeni, mis sisaldab valgu tootmiseks vajalikku geneetilist teavet, tuleks vastava valgu sünteesimiseks väljendada. Geeniekspressioon toimub kahes põhietapis, nimelt transkriptsioonis ja translatsioonis. Seega on transkriptsioon geeniekspressiooni esimene etapp. Sellele järgneb tõlkimine. Transkriptsiooni käigus muundub DNA geneetiline teave mRNA-s kolmetäheliseks geneetilise koodi järjestuseks. Tõlke käigus muundatakse mRNA polüpeptiidide ahelaks.
