Pteridofüütide ja fanerogammide peamine erinevus seisneb selles, et pteridofüüdid on seemneteta ja õiteta soontaimed, samal ajal kui fanerogaamid on seemned ja lille kandvad soontaimed.
Kingdom Plantae'l on kaks alamriiki nagu cryptogamae ja Phanerogamae. Cryptogamae hulka kuuluvad taimed, mis paljunevad eoste kaudu. Seega on need taimed seemneteta ja õiteta taimed. Alamriigil on kolm peamist rühma: Thallophyta, Bryophyta ja Pteridophyta, kuhu kuuluvad samblad, vetikad, samblikud ja sõnajalad. Seevastu alamriiki Phanerogamae kuuluvad seemnetaimed gymnospermid ja angiospermid. Nad toodavad nähtavaid paljunemisstruktuure, mida nimetatakse lilledeks. Nii pteridofüüdid kui ka phanerogams on soontaimed. Selle artikli peamine eesmärk on arutada erinevust pteridofüütide ja fanerogamide vahel.