Peamine erinevus E. coli ja Klebsiella vahel on see, et E. coli on gramnegatiivne vardakujuline bakter, mis on liikuv, samas kui Klebsiella on gramnegatiivsete vardakujuliste bakterite perekond, mis on liikumatu.
Escherichia ja Klebsiella on kolibakterite kaks tavalist perekonda. Mõlemad perekonnad koosnevad gramnegatiivsetest vardakujulistest, eoseid mitte moodustavatest bakteritest. E. coli on Escherichia liik. See on liikuv fekaalne kolibakter. Nii E. coli kui ka Klebsiella bakterid kuuluvad Enterobacteriaceae perekonda. Nad on osa meie soolestiku normaalsest taimestikust. Lisaks on nad fakultatiivsed anaeroobid. Mõlemad on üldiselt kahjutud, kuid teatud olukordades muutuvad nad inimese oportunistlikeks patogeenideks.