Peamine erinevus hübriid- ja degenereerunud orbitaalide vahel on see, et hübriid-orbitaalid on uued orbitaalid, mis tekivad kahe või enama orbitaali segunemisel, samas kui degenereerunud orbitaalid eksisteerivad algselt aatomis.
Nagu nimigi ütleb, on hübriidorbiit kahe või enama orbitaali hübriid. Ehkki degenereerunud orbitaali nimi näib sama, ei ole need äsja moodustatud orbitaalid - nad eksisteerivad juba aatomis. Pealegi on kõigil molekuli hübriidorbitaalidel sama energia, aatomi degenereerunud orbitaalidel aga sama energia.
