Peamine erinevus autoloogse ja allogeense tüvirakkude siirdamise vahel on see, et autoloogse tüvirakkude siirdamise korral kasutatakse siirdamisel enda rakke, samas kui allogeensete tüvirakkude siirdamisel sobitatakse doonor enne siirdamist ja manustatakse seejärel.
Tüvirakkude siirdamine on tehnika, mida kasutatakse peamiselt vähi ravis. Tüvirakkude siirdamisel manustatakse sobivate arenenud omadustega tüvirakke nii, et neist areneksid immunoloogilised rakud, mis on võimelised hävitama vähirakke. Selle teine ülesanne on kaitsta keha pahaloomulisi rakke. Autoloogne ja allogeenne tüvirakkude siirdamine on kahte tüüpi tüvirakkude siirdamise tehnika. Autoloogse tüvirakkude siirdamisel kasutatakse siirdamiseks enda tüvirakke, samas kui allogeensetes tüvirakkude siirdamises kasutatakse sobitatud doonori tüvirakke.