Peamine erinevus juhusliku ja trükitud X-inaktiveerimise vahel on see, et juhuslik X-inaktiveerimine on isaliku või ema X-kromosoomi inaktiveerimine võrdse tõenäosusega epiblastis gastrulatsiooni ajal, samas kui trükitud X-inaktivatsioon on isalt saadud X-i juhuslik X-inaktiveerimine kromosoom imetajate ekstraembrüonaalsetes kudedes.
X inaktivatsioon on emasimetajatel täheldatav protsess. Üldiselt on emastel kaks X-kromosoomi. Naiste imetajatel muutub üks X-kromosoom passiivseks. Teisisõnu muutub üks X-kromosoom transkriptsiooniliselt passiivseks struktuuriks. Kui see juhtub, jääb see konkreetne X-kromosoom kogu raku ja selle järeltulijate organismis elu vältel passiivseks. Lisaks kondenseerub inaktiveeritud X-kromosoom kompaktseks struktuuriks, mida nimetatakse Barri kehaks, ja seda hoitakse stabiilselt vaikses olekus. Samuti sõltub X inaktiveerimisprotsess kahe mittekodeeriva komplementaarse RNA kontrollimisest. X-i inaktivatsiooni ei toimu aga meestel, kellel on ainult üks X-kromosoom. Veelgi enam, X inaktiveerimine võib toimuda juhuslikult või jäljendamise tõttu.
