Peamine erinevus epistaasi ja pleiotroopia vahel on see, et epistaas on nähtus, kus üks geen ühes lookuses muudab geeni fenotüübilist ekspressiooni teises lookuses, samal ajal kui pleiotropy selgitab nähtust, milles üks geen mõjutab mitut fenotüübilist tunnust.
Epistaas ja pleiotroopia on geneetikas kaks nähtust. Epistaas tekib siis, kui rohkem kui üks geen määrab ühe fenotüübi. Seetõttu mõjutab üks geen epistaasis teise geeni ekspressiooni, mis asub teises lookuses. Seevastu pleiotroopia tekib siis, kui üks geen määrab mitu fenotüüpi. Seega aitab üks geen kaasa mitmetele omadustele. Mõlemad epistaasid ja pleiotroopia on Mendeli pärandi variatsioonid.
