Peamine erinevus geeni lisamise ja geeni asendamise vahel on see, et geeni lisamine on geeni sisestamine mittehomoloogilise rekombinatsiooni teel, samas kui geeni asendamine on endogeense geeni asendamine homoloogse rekombinatsiooniga.
Geeniteraapia on tehnika, mis kasutab geene geneetiliste haiguste raviks. Seetõttu hõlmab see geenide sisestamist või viimist patsiendi rakku. Teisisõnu hõlmab geeniteraapia defektsete või haigust põhjustavate geenide asemel geenide asendamist või lisamist. Selles protsessis on asendamiseks või lisamiseks õige geeni valimine ülitähtis. Seetõttu ei ole geeniteraapia inimeste haiguste ravimisel ikka veel 100% edukas. Paljusid geneetilisi haigusi ei saa geeniteraapiaga ravida. Kuid geeniteraapia on paljutõotav ravi väheste haiguste puhul, nagu lihasdüstroofia ja tsüstiline fibroos jne.
