Peamine erinevus - üldised vs konkreetsed transkriptsioonifaktorid
RNA polümeraas nõuab mRNA sünteesimisel DNA matriitsil toimimiseks transkriptsioonifaktoreid. Transkriptsioonifaktoreid on erinevat tüüpi. Need transkriptsioonifaktorid moodustavad kompleksi DNA ahelaga. Need kas muudavad matriitsi kinnitust või suurendavad RNA polümeraasi ensüümi afiinsust mRNA sünteesi suhtes nn transkriptsiooni protsessis. Transkriptsioonifaktoreid on kahte tüüpi. Need on üldised või basaalse transkriptsiooni tegurid ja spetsiifilised transkriptsioonifaktorid. Üldised transkriptsioonifaktorid on tegurid, mida kasutatakse initsiatsioonikompleksi moodustamiseks transkriptsiooni käigus. Neid leidub peaaegu kõigis eukarüootides ja prokarüootides moodustavad nad vähem keeruka kompleksi. Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on kas võimendajad või repressorid,mis on spetsiifilised DNA järjestused, mis aktiveerivad või pärsivad üldist transkriptsiooniprotsessi. Mõned spetsiifilised transkriptsioonifaktorid võivad muuta DNA järjestust ise. Peamine erinevus üldiste transkriptsioonifaktorite ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel põhineb funktsionaalsusel. Üldised transkriptsioonifaktorid on seotud transkriptsiooniprotsessi initsiatsioonieelse kompleksi moodustamisega, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid osalevad kas transkriptsiooniprotsessi aktiveerimisel või represseerimisel. Üldised transkriptsioonifaktorid on seotud transkriptsiooniprotsessi initsiatsioonieelse kompleksi moodustamisega, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid osalevad kas transkriptsiooniprotsessi aktiveerimisel või represseerimisel. Üldised transkriptsioonifaktorid on seotud transkriptsiooniprotsessi initsiatsioonieelse kompleksi moodustamisega, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid osalevad kas transkriptsiooniprotsessi aktiveerimisel või represseerimisel.
SISU
1. Ülevaade ja peamised erinevused
2. Mis on üldised transkriptsioonifaktorid
3. Mis on spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
4. Üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite sarnasused
5. Kõrvuti võrdlus - üldine vs spetsiifilised transkriptsioonifaktorid tabelina
6. Kokkuvõte
Mis on üldised transkriptsioonifaktorid?
Üldised või basaalse transkriptsiooni tegurid on tegurid, mis osalevad initsiatsioonikompleksi moodustumisel transkriptsiooni ajal. Need on transkriptsiooniprotsessi jaoks hädavajalikud, seega on neil edukas transkriptsioonis ülioluline roll. Üldisi transkriptsioonifaktoreid on kuus. Nemad on; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF ja TFIIA. Initsiatsioonikompleksi moodustamisel mängivad nad erinevaid rolle.
- TFIID - see transkriptsioonifaktor (TF) on seotud promootorjärjestuse (TATA kast) äratundmisega.
- TFIIB - promootori / TFIID kompleksi tunneb ära TFIIB. See annab signaali peamise katalüüsiva ensüümi RNA polümeraasi seondumise kohta.
- TFIIF - see transkriptsioonifaktor on seotud RNA polümeraasiga. Seega osaleb TFIIF protsessis, värvates RNA polümeraasi õigesse kohta.
- TFIIE ja TFIIH - nende transkriptsioonifaktorite seondumine tähistab initsiatsioonieelse moodustumise lõppu. Nende seondumine suurendab initsiatsioonieelse kompleksi moodustumise efektiivsust.
- TFIIA edendab TFIID-i sidumist TATA-kastiga.
Joonis 01: üldised transkriptsioonifaktorid
Eespool nimetatud üldised transkriptsioonifaktorid on spetsiifilised RNA polümeraas II jaoks, mis on RNA polümeraasi tüüp, mis pikendab mRNA ahelat. RNA polümeraas I ja III on seotud üldiste transkriptsioonifaktoritega. Üldised transkriptsioonifaktorid võivad erineda ka rakutüübi järgi, millele see toimib.
Mis on spetsiifilised transkriptsioonifaktorid?
Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on piirkonnad, mis asuvad ka DNA järjestustes. Nad on enamasti kas võimendajad või repressorid. Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on spetsiifilised cis-toimega elemendid matriits-DNA ahelas, mis läbivad transkriptsiooni. Nende spetsiifiliste võimendajate ja repressorite aktiveerimine osaleb ensüümi afiinsuse suurendamises, muutes DNA molekuli orientatsiooni või toimides signaalialadena. Spetsiifilisi transkriptsioonifaktoreid kasutatakse ka DNA matriidi ahela modifikatsioonide esilekutsumiseks. Need modifikatsioonid hõlmavad peamiselt kovalentseid modifikatsioone nagu metüülimine. Seetõttu toimivad metüleeritud DNA piirkonnad transkriptsiooniprotsessi spetsiaalsete võimendajate või repressoritena.
Joonis 02: Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid sõltuvad liigi tüübist ja neid ei leidu tavaliselt kõigis eukarüootides. Neid transkriptsioonifaktoreid aktiveerivad erinevad metaboolsed tingimused signaaliülekande radade kaudu. Aktiveerimisel reguleerivad nad geeni ekspressiooni transkriptsiooni tasemel.
Millised on üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite sarnasused?
- Transkriptsiooni protsessis on vaja mõlemat tegurit.
- Mõlemad tegurid mõjutavad organismi geeniekspressiooni.
- Mõlemad tegurid aitavad reguleerida RNA polümeraasi funktsiooni transkriptsiooniprotsessis.
- Mõlemat tegurit leidub enamasti eukarüootides.
Mis vahe on üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel?
Erinev artikkel keskel enne tabelit
Üldine vs spetsiifiline transkriptsioon |
|
| Üldised transkriptsioonitegurid on tegurid, mida kasutatakse initsiatsioonikompleksi moodustamiseks transkriptsiooni käigus. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on kas võimendajad või repressorid, mis on spetsiifilised DNA järjestused, mis aktiveerivad või pärsivad üldist transkriptsiooniprotsessi. |
| Molekuli tüüp | |
| Üldised transkriptsioonifaktorid on valgupõhised. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on nukleotiidjärjestused. |
| Moodustumine | |
| Üldised transkriptsioonifaktorid moodustavad transkriptsiooni algatamise ajal initsiatsioonieelse kompleksi. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid toimivad transkriptsiooni võimendajate või repressoritena. |
| Tüübid | |
| Neid on kuus peamist tüüpi; Üldiste transkriptsioonifaktorite TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE ja TFIIA. | Spetsiifilised transkriptsioonifaktorid liigitatakse peamiselt võimendajateks ja repressoriteks. |
Kokkuvõte - üldised vs spetsiifilised transkriptsioonifaktorid
Transkriptsioonifaktorid on transkriptsiooniregulatsiooni jaoks hädavajalikud ja need on vajalikud protsessi suurema tõhususe ja täpsuse tagamiseks. Transkriptsioonifaktorid on kahte peamist tüüpi; Üldine / põhi- ja spetsiifiline. Üldised transkriptsioonifaktorid on seotud initsiatsioonieelse kompleksi moodustumisega transkriptsiooni ajal, samas kui spetsiifilised transkriptsioonifaktorid on DNA enda piirkonnad, mis toimivad võimendajate või repressoritena. Üldised transkriptsioonifaktorid põhinevad valgul ja seda vajavad kõik eukarüoodid. Seda ei varieerita laialdaselt ja see jääb ühtlaste molekulidena. Spetsiifiline transkriptsioonifaktor võib olla väga erinev ja sõltub indiviidi geneetilisest koosseisust. See on erinevus üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel.
Laadige alla üldiste vs konkreetsete transkriptsioonifaktorite PDF-versioon
Selle artikli PDF-versiooni saate alla laadida ja kasutada võrguühenduseta eesmärkidel, nagu tsiteeritud. Laadige siit alla PDF-versioon. Erinevus üldiste ja spetsiifiliste transkriptsioonifaktorite vahel
