Peamine erinevus geeni knockouti ja knockdown'i vahel on see, et geeni knockout on tehnika, kus huvipakkuv geen on geeni funktsioonide uurimiseks täielikult eemaldatud (mitteaktiivne), samas kui geeni knockdown on teine meetod, kus huvipakkuv geen on vaigistatud konkreetse geeni roll bioloogilises süsteemis.
Elavate bioloogiliste süsteemide geenide toimimise uurimiseks kasutatakse erinevaid geneetilisi meetodeid. Geenide väljalülitamine ja koputamine on kaks sellist tehnikat. Need meetodid aitavad teadlastel tuvastada elusorganismide erinevate geenide funktsionaalseid aspekte.