Peamine erinevus glüoksüsoomide ja peroksisoomide vahel on see, et glüoksüsoome esineb ainult taimerakkudes ja niit-seentes, samas kui peroksisoomid esinevad peaaegu kõigis eukarüootsetes rakkudes. Glüoksüsoome on rohkesti idanevate seemnete taimerakkudes, peroksisoome aga maksa- ja neerurakkudes.
Need kaks organelli on mikrokehad, mis esinevad eukarüootsetes rakkudes. Glüoksüsoomid on spetsialiseerunud peroksisoomid, mida leidub ainult taimerakkudes ja niit-seentes. Peroksisoomid on organellid, mis aitavad lagundada pikki rasvhapete ahelaid ja detoksifitseerida rakku. Nad lagundavad alkohole ja muid kahjulikke ühendeid.
