Peamine erinevus protostoomide ja deuterostoomide vahel on see, et protostoomides muutub blastopore suuks, deuterostoomides aga pärakuks. Teine oluline erinevus on see, et protostoomide embrüod läbivad spiraalse lõhustumise, samal ajal kui deuterostoomide embrüod radiaalse lõhustumise.
Nende kahe mõiste mõistmisel oleks oluline pöörata tähelepanu sellele, kuidas organismide embrüo areng toimub. Eriti oluline oleks kaaluda koomaga loomi, mis on vedelikuga täidetud õõnsus, mis asub endodermi (soolestik) ja mesodermi (enamasti lihaskiht) vahel; teisisõnu, coelom on imetajate kõhukelme. Protostoomid ja deuterostoomid on kaks peamist koomeloomade tüüpi ja nende vahel on palju erinevusi. Need erinevad peamiselt selle poolest, kuidas nende suu ja pärak moodustuvad embrüonaalsete arengute käigus.
