Peamine erinevus molekulaarse liikumise ja difusiooni vahel on see, et molekulaarne liikumine on molekulide liikumine aine sees ilma välise mõjutuseta, difusioon aga molekulide liikumine kõrge kontsentratsiooniga piirkonnast madalama kontsentratsiooniga piirkonda.
Molekulaarne liikumine ja difusioon on ainemolekulide käitumise seletustena väga olulised. Kogu aine sisaldab osakesi; aatomid, ioonid või molekulid. enamasti võime aatomite või ioonide asemel leida molekule, kuna molekulid on stabiilsemad. Pealegi on kõik aine vormid alati ühes kolmest aine olekust; gaas, vedel või tahkis. Molekulide liikumist nendes kolmes olekus kirjeldavad molekuli liikumine ja difusioon.
