Peamine erinevus polüatoomiliste ioonide ja ühendite vahel on see, et polüatoomilistel ioonidel on kas positiivne või negatiivne elektrilaeng, samas kui ühenditel puudub netoelektrilaeng.
Polüatoomiline ioon on termin, mida kasutame keemiliste liikide nimetamiseks, mis sisaldavad kahte või enamat aatomit, millel on neto negatiivne või positiivne elektrilaeng. Selle iooni elektrilaeng tuleneb igas aatomis olevate elektronide arvust; kui elektrone on rohkem kui prootonite koguarv aatomites, saab see negatiivse netolaengu ja vastupidi. Ühendid on seevastu keemilised liigid, millel puudub elektrilaeng. Neil on võrdne arv elektrone ja prootoneid.
