Peamine erinevus troponiin I ja troponiin T vahel on see, et troponiin I seondub aktiiniga, samal ajal kui troponiin T seondub lihaste kontraktsioonide ajal tropomüosiiniga.
Troponiinid on olulised valgumolekulid, mis on seotud lihaste kokkutõmbumisega. Troponiini uuringud suurenevad laialdaselt, kuna see on südame isheemiatõvete südamemarkerina oluline. Inimese füsioloogias on troponiine kolme tüüpi. Kolm eraldi geeni kodeerivad neid kolme tüüpi troponiini; Troponiin C, Troponiin T ja Troponiin I. Troponiini I ja Troponiini T kasutatakse prognoosides südamemarkeritena. Seega seondub troponiin I lihaste kokkutõmbumiste ajal aktiinifilamentidega, et hoida aktiin-tropomüosiini kompleksi paigas. Teiselt poolt seondub Troponin T lihaste kokkutõmbumise ajal tropomüosiiniga. Troponiin T aitab tropomüosiinil aktiinil puhata. Seetõttu on peamine erinevus troponiin I ja troponiin T vahel substraat, millega nad lihaste kokkutõmbumise ajal seonduvad.
