Peamine erinevus geeniekspressiooni ja geeniregulatsiooni vahel on see, et geeniekspressioon on protsess, mis toodab geenis peituvast geneetilisest teabest funktsionaalse valgu või RNA, samas kui geeniregulatsioon on protsess, mis kutsub esile või surub alla geeni ekspressiooni.
Geen on spetsiifiline DNA fragment, mis asub kromosoomis. See koosneb intronitest, mis ei ole kodeerivad järjestused, ja eksonitest, mis on kodeerivad järjestused. Geenid läbivad valkude tootmiseks kaks peamist etappi. Nukleotiidide spetsiifiline järjestus määrab saadud valgu. Seega on tõesti oluline geenide ekspresseerimine ja reguleerimine, et vältida tarbetute valkude tootmist, mis võivad põhjustada mitmesuguseid probleeme, sealhulgas geneetilisi häireid, sündroome jne. Seega on geeniekspressioon ja geeniregulatsioon elusorganismides kaks äärmiselt olulist protsessi. Kumbki neist protsessidest ei toimu siiski eraldi; mõlemad protsessid toimuvad üheaegselt.
