Peamine erinevus tahkekäärimise ja sukeldatud kääritamise vahel seisneb selles, et tahkekäärimine hõlmab mikroorganismide kultiveerimist madala niiskusesisaldusega tahkel substraadil, sukeldatud käärimine aga mikroorganismide kasvatamist vedelas keskkonnas, mille veesisaldus on üle 95%.
Mikroorganismid on kasulikud erinevat tüüpi tööstusharudes. Bakteritel ja seentel on tööstuses eriti palju rakendusi. Mikroorganismid peaksid mikroorganismide ainevahetusest tulenevate vajalike toodete eraldamiseks tööstuslikus käärimisprotsessis laialdaselt kasvama. Tahkekäärimine ja sukeldamine on kaks peamist tüüpi fermentatsiooni, mis aitavad ensüüme toota tööstuslikult. Tahkekäärimisel toimub käärimine tahkel substraadil kasvanud mikroorganismide poolt, sukeldatud kääritamisel aga kääritamine vedelas keskkonnas kasvanud mikroorganismide poolt. Igal meetodil on nii eeliseid kui ka puudusi.
