Peamine erinevus mööduva ja tasakaalustatud polümorfismi vahel põhineb alleelide käitumisel. Mööduv polümorfism on geeni ühe alleeli järk-järguline asendamine teise alleeliga, samal ajal kui tasakaalustatud polümorfism on geeni mõlema erineva alleeli säilimine aja jooksul
Geneetiline polümorfism on konkreetse DNA üks või kaks või enam varianti. Mööduv ja tasakaalustatud polümorfism on kahte tüüpi polümorfismi, mis tekivad geeni kahe vahelduva alleeli tõttu. Mööduva polümorfismi korral asendatakse üks alleel antud lookuse kahest alternatiivsest alleelist järk-järgult teisega. Tasakaalus polümorfismis on need kaks alleeli omavahel tasakaalus. Geeni mõlemad versioonid on populatsioonis säilinud.
